「北部都会区」另一重点是将原有的铁路进一步发展伸延；其中，已落实兴建、由现时屯马线「锦上路」站至「古洞」站的「北环线」，就会发展出另一条跨境支线，成为「双城三圈」空间概念中「港深紧密互动圈」的主轴。

「北环线」原本将增设「凹头」、「牛潭尾」、「新田」及「古洞」四个站，《发展策略》提出于「北环线」另建支线，由「新田」转车，往深圳新皇岗口岸，途经「洲头」、「港深创科园」两个站。这条支线连系了「北部都会区」的重点项目「新田科技城」，并打通北上或南下的脉络。

「北环线」除了设跨境支线外，《发展策略》亦同时提出向东伸延，为文锦渡及老鼠岭变身成为新世代综合商住区打下基础。粗略估计，该区可提供约7.5万至8.5万个住宅单位，规模大约为6 个太古城。而「北环线」就成为区内外的主要交通运输途径。

「北环线」东延共设有八个分站，是整个「北部都会区」新发展中，最大规模的铁路项目。发展走线：由「北环线」原有的「古洞」站开始，往东北方向至「罗湖南」、「文锦渡」、「老鼠岭」，至「香园围」后绕向南，经「打鼓岭」、「坪輋」、「皇后山」，并以粉岭「安乐村」为终站，顺时针方向划成一个「半月形」；而「安乐村」更会以将建无缝行人系统接驳东铁「粉岭」站，乘客可步行转车，估计安排与目前「尖沙咀」站到「尖东」站转车相类似。「北环线」东延线形成连贯多个策略发展项目及现有小区的铁路网络，带动土地开拓，释放发展潜力。

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